Implantation de logiciel de gestion (ERP): ne pas confondre rigidité et rigueur

Le variant Omicron (« sud-africain ») arrive : faut-il le craindre?

Variant sud-africainOn parle beaucoup de l'arrivée en Europe du variant Omicron (15° lettre de l’alphabet grec) également connu comme « sud-africain ». Le variant B.1.1.529 fait à son tour son entrée dans le triste panthéon des virus du covid. La propagation de cette souche est-elle un danger immédiat, en particulier pour les personnes en attente de la troisième dose de vaccin ? Parlera-t-on aussi d'échappement immunitaire à propos des mutations que la souche sud-africaine porterait? Quant à la virulente du B.1.1.529 par rapport aux souches précédentes, c'est bien ce qui inquiète et cause un vent de panique partout dans le monde.

Infirmière sud-africaine contre le Covid

🕐 Aujourd'hui dimanche 22 mai 2022, je n'ai pas de nouvelle particulière sur le variant Omicron, à part dire qu'il est moins létal.

🕐 Lundi 29 novembre 2021 - Le variant sud-africain se propage très lentement dans le monde pour l'instant mais inquiète beaucoup. La question de la fermeture des frontières avec l'Afrique du sud est au coeur des débats. La progression en Europe a commencé avec le cas belge, même si cela reste stable après les premiers diagnostics récents. On parle aussi de plusieurs cas d'Omicron en Grande Bretagne et d'un cas suspect en Allemagne. On sait aussi qu'une soixantaine de ressortissants hollandais arrivés d'Afrique australe ont été mis en quarantaine à Amsterdam après avoir été testés positifs.

La nouvelle souche du Covid-19 qui fait parler d'elle a aussi sa lettre grecque, il s'agit de la lettre Omicron. Suprême consécration pour un variant qui vient du sud du continent africain et dont le nom de code était peu poétique: B.1.1529. Depuis que l'OMS a enfin classifié le variant Omicron comme souche du SARS-CoV-2, on sait qu'il est susceptible de mutation au fil du temps (on parle d'une trentaine de mutations depuis la souche originelle chinoise de Wuhan), la preuve puisqu'une 5ème vague déferle actuellement sur l'Europe avec des infections qui ont fortement augmentées. Est-on certain de l'efficacité des vaccins existants ? C'est un autre débat. 🔥

Je terminerai juste mon commentaire du jour en rappelant qu'avec Omicron, une menace plane maintenant sur Noël. Faudra-t-il repartir sur des attestations de déplacement et de voyage en France ? Avec des zones rouges définies par arrêté du ministre chargé de la Santé ? J'espère qu'on n'en reviendra pas là d'ici un mois.

Vidéo: Variant sud-africain

🕐 Samedi 27 novembre 2021 - Nouvelle inquiétude autour de deux voyageurs à Orly arrivant d'Afrique du sud. Depuis quelques jours les milieux covidiques ne parlent plus que du variant sud-africain qui prendra bientôt le pas dans les médias sur le variant Delta resté pourtant ultra majoritaire dans les contaminations. 🔥 Les informations à ce sujet ne sont pas nombreuses, je vais tenter malgré tout comme blogueur de faire ce devoir d'information même si le covid n'a pas de rapport en soi avec le fait de créer un blog d'entreprise. Les médias grand public ne vous parleront pas de certaines réalités, c'est la tâche d'un rédacteur web (ou blogueur) de le faire. En attendant les frontières se referment, plusieurs pays sont amenés à suspendre les vols depuis l'Afrique du Sud à cause de cette variante potentiellement très contagieuse.

Se pourrait-il que le nouveau variant soit déjà présent en France, mais qu'on ne le sache pas encore ? Dès que le résultat du séquençage sera connu, on aura le fin mot de l'histoire sur ces deux voyageurs d'Orly arrivant d'Afrique du sud. L'hôpital Henri-Mondor à Créteil s'occupera de ce séquençage, pour enfin connaître ce qu'il en est du nouveau variant. Les patients suspectés sont mis à l'abri. Deviendra-t-il un jour le variant dominant à la place du Delta dans la population française ? Rien ne permet encore de le dire malgré sa capacité d'infection et un risque de transmissibilité accru. En tout cas jamais un variant n'avait provoqué autant d'inquiétude que Omicron qui est déjà sur le sol européen.

🕐 Vendredi 26 novembre 2021 - Une demi-douzaine de pays pour l'instant (Afrique du sud, Malawi, Botswana, Israël, Hong Kong, Belgique) ont signalé le B.1.1529 venu d'Afrique du sud à l'origine. On se souvient les épisodes de progression d'autres variants en août dernier, qui a fait prendre conscience à l'opinion européenne qu'une nouvelle variété de coronavirus fait son entrée. Rien ne prouve qu’il soit plus rapide en terme de contamination que le variant Delta. On ignore également si l'immunité vaccinale contre le virus Omicron fontionne, par manque de données à analyser pour l'instant.

Comme la vaccination progresse, on espère que tout ira bien même si les hospitalisations et des réanimations ont repris récemment en France avec de nombreuses écoles fermées. Si une autre souche du Coronavirus vous a touchée que vous avez été guéri, ou si simplement vous êtes vacciné, cela n'empêche nullement que vous soyez contaminé. Le Covid et ses variants ne semble en effet pas vouloir nous laisser en paix. A quel point le variant d'Afrique du sud est-il plus dangereux ? C'est impossible à dire pour l'instant, en tout cas le Covid-19 est toujours là.

Connaître la contagiosité et la vraie dangerosité du nouveau variant covid sud-africain n'est pas facile car les données manquent. Tant que les laboratoires n'en dispose pas suffisamment, il est difficile de se prononcer même si le variant inquiète. Au fond que sait-on de ce variant ? Peu de choses d'après les autorités sanitaires, à part les conditions de son apparition et comment il s'est propagé d'Afrique australe au Malawi, au Botswana et en Israêl, puis de là sur le continent européen avec ce positif en Belgique.

🕐 Jeudi 25 novembre 2021 - Un nouveau variant du Covid-19 a été détecté aujourd'hui par une équipe de scientifiques sud-africains. Je reprends donc l'édition de cette page consacrée à l'actualité du covid car je suis poursuivi par cette actualité. L'alphabet grec de l’OMS est maintenant utilisé pour ce variant appelé Omicron, même si on continue à dire qu'il vient d'Afrique du sud d'où le nom de covid sud-africain. Il a déjà été classé "préoccupant" par l'OMS, cela va beaucoup plus vite que pour d'autres souches avec le B.1.1529. Les personnes qui en sont porteur ne présentent pas toujours de symptome. Le malade identifié en Israël venanit du Malawi, ce n'est pas un local.

Le danger pour la vie que représente le variant du covid sud-africain n'est donc pas encore totalement avéré. Au moins cela arrêtera d'alimenter la controverse politique autour des élections présidentielles et la possibilité qu'Eric Zemmour soit au second tour! Surtout qu'on ne sait pas si l'immunité collective reste possible avec le B.1.1529. On ne sait pas si cet hiver la moitié de l'Europe va devoir rester confinée à cause de ce variant Omicron. Alors, le variant sud-africain est-il significatif un nouveau pas vers un reconfinement ? En tout cas « la transparence » des sud-africains a été saluée par les Etats-Unis.

Il est tôt pour parler de vague de contaminations concernant la souche B.1.1529, ce ne sont que quelques cas dans le monde depuis que les laboratoires l'ont détecté, même si cela cristallise déjà les craintes. Remarquons qu'on ne parle plus de « schéma vaccinal complet » puisque les Français ont compris que la vaccination est devenue permanente. En tout cas l'Afrique australe se retrouve aux prises avec une nouvelle variante du coronavirus, avec les restrictions de voyage que cela imposera aux ressortissants du pays avec cette flambée des cas imposant des mesures draconiennes.

Covid-22 super-variant

Archives juillet - août 2021

La précédente vague épidémique concernait le variant Mu (« colombien ») cet été, voici ce que j'en disais à l'époque. C'était avant l'apparition du nouveau variant du coronavirus.

🕐 Lundi 30 août - Santé publique France dit que le variant colombien est très rare en France, ce qui signifie un niveau de circulation très faible. En tout cas, globalement. En clair on parle d'une cinquantaine de cas confirmés dans l’Hexagone au mois de juillet d'après Gisaid (Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data) et Santé publique France. Ironiquement si la souche B1621 est apparue en Colombie (d'où son nom de Variant colombien) elle n'est pas majoritaire dans ce pays puisqu'on parle de 35 % du total des séquences déposées depuis début mai.

Les souches du Covid19 adorent se faire concurrence entre eux. Le variant colombien (B.1.621) va-t-il concurrencer le variant Delta ? Est-il plus transmissible ? Cela semble peu probable. Comme le variant Delta domine actuellement partout dans le monde, il n'y a pas lieu de s'interroger pour l'instant. Le VOC (variant of concern) c'est-à-dire le variant préoccupant du moment reste le Delta. Pour le variant colombien on se contentera du vocable de « variant of interest », en clair le parent pauvre du Covid19.

Aurons-nous un jour un vaccin vraiment efficace contre tous les variants, même ceux encore très peu présent en France? Parmi les décès certains avaient des soucis de santé, mais d'autres se portaient bien. Du coup que valent les vaccins contre ce nouveau variant colombien? Concernant les personnes totalement vaccinées, le sujet a fait couler beaucoup d'encre. Et encore, le b.1.621 a à peine commencé à faire son apparition en France.

Pourquoi n'a-t-il pas été rebaptisé par une lettre de l’alphabet grec? Justement parce qu'il circule encore très peu. Etant moins transmissible que le variant Delta, on ne voit pas comment il pourrait le supplanter. Il faut le surveiller de près néanmoins. Sa virulence ou résistance aux vaccins n'a pas encore été testée. On cite 3 mutations d’intérêt concernant la souche B1621, à savoir: E484K, N501Y et P681H. Or le variant Beta apparu en Afrique du Sud porte aussi le E484K, c'est pourquoi on parle de risque d’échappement immunitaire. 🔥

🕐 Samedi 28 août - L'agitation des réseaux sociaux en début de semaine autour du Covid-22 s'est un peu calmée. En revanche le mystérieux variant B.1.621 se propage toujours en Floride. On se souvient qu'avant d'arriver dans le sud des Etats-Unis, ce variant était apparu en Colombie début 2020 il y a déjà un an et demi. La presse américaine rapporte les déclarations des experts de Floride, selon lesquelles divers variants du COVID-19 se propagent toujours dans l'État. Les responsables de santé en Floride ont exprimé leur inquiétude quant à la propagation et l'émergence de nouveaux variants dangereux du COVID-19. Quels sont ceux qui se propagent en Floride ? 🤔

Michael Teng, professeur associé du Collège de médecine interne de l'Université de Floride du Sud, a déclaré à WFLA-TV que pami les variants se propageant dans la région on trouve le variant lambda. Désignée comme variant d'intérêt (« variant of interest ») par l'OMS, il domine en Amérique du Sud et au Pérou et a déjà fait la une des journaux américains en tant que variante émergente aux États-Unis. Des recherches récentes suggèrent que ce variant péruvien pourrait échapper aux vaccins COVID-19.

L'autre variant qui préoccupe les autorités de santé est la souche colombienne du SARS-CoV-2, en clair le variant B.1.621. Il s'est répandu rapidement dans la région de Jacksonville, en Floride. Bien que le nouveau variant colombien n'aie pas encore reçu de désignation de la part de l'OMS, c'est pour cela qu'on l'appelle le B1-621, il est cependant devenu dominant en Colombie. Aussi bien le variant lambda en France n'a pas encore fait parler de lui, mais lui et le virus colombien (rappelez-vous en Belgique à Zaventem dans la banlieue de Bruxelles) ont un certain niveau de transmissibilité.

🕐 Vendredi 27 août - Qu'est-ce que le variant B.1.621 ? S'agit-il de la variante zeta ? Les informations concernant la souche b1621 du corona ont commencé à se répandre au début du mois d'août, aussi bien en Floride qu'en Belgique dans la maison de retraite où il a fait de nombreux morts. Peu avant la contamination par le covid (variant b1621) en Belgique, le Washington Post avait rapporté en parallèle que la variante B.1.621, identifiée à l'origine en Colombie, s'était retrouvée dans le sud de la Floride. Alors imaginez ce que pourrait donner un Colombien en France ! 😉

Le Dr Peter Hotez, doyen de l'École nationale de médecine tropicale du Baylor College of Medicine, a déclaré que le variant covid colombien présentait certaines modifications qui le rendent similaire au variant delta dont la virulence fait des ravages en France. Cependant il a ajouté que le variant colombien a également des liens avec le variant sud-africain et brésilien, ce qui le rend plus transmissible. Et il y a eu des spéculations sur le fait que la variante colombienne pourrait échapper aux vaccins.

Ce nouveau coronavirus (variant colombien) n'a pas encore une désignation en lettres grecques. Le Dr Peter Hotez a proposé qu'il lui soit donnée la désignation ζ (zéta en grec). A l'heure où se pose la question de la protection des jeunes scolarisés (la rentrée scolaire approche) ces débats sémantiques n'ont guère de sens. Au moins une nouvelle étude américaine révèle que les vaccins Pfizer et Moderna évitent deux tiers des contaminations au variant Delta. Cela n'empêchera pas le débat sur la 3e dose du vaccin: inutile pour certains, prématurée pour d'autres.

Vidéo: Variant colombien

🕐 Jeudi 26 août - On admet sans peine que le nouveau variant détecté venant de Colombie avait fait 7 morts au mois du mois d'août (les victimes ayant entre 80 et 93 ans). 👌 Outre ce fait irréfutable, on en sait pas grand chose sur le nouveau variant colombien en Belgique. Le fait qu'il soit déjà responsable de ces sept morts et que le schéma vaccinal des résidents de l'Ehpad Ter Burg (nord-est de Bruxelles) touchés était complet ne permet pas de tirer de grandes conclusions. Effectivement les victimes étaient des résidents tous vaccinés d'une maison de repos ayant été contaminés par ce nouveau variant B1621.

Début août les autorités de santé en Belgique avaient commencé par dire qu'un visiteur asymptomatique venu voir un patient serait à l’origine de la contamination dans cette maison de retraite. Plus tard il a été indiqué que ce point zéro de contamination est discutable, l'origine de l'infection ne proviendrait pas de ce malade asymptomatique. Au final, nous n'avons aucune idée de comment la variante colombienne a pénétré la maison de retraite. Bref on parle quand même d'une nouvelle mutation du coronavirus, laquelle rend les autorités inquiètes car de nouveaux foyers de contaminations peuvent se déclarer. Si cela est avéré, ils devront faire l'objet d'un suivi minutieux.

Le virus colombien de Belgique sera-t-il plus résistant à l’immunité vaccinale ou naturelle? On l'ignore pour l'instant. En tout cas la progression du variant apparu en Colombie dans les chaînes de contamination provoque bien une montée du taux d'incidence dans certaines régions comme les Hauts-de-France. Est-il en train progressivement de remplacer toutes les autres souches du coronavirus? Non, pour l'instant on en est loin face au variant Delta qui reste majoritaire. Cela n'a pas changé depuis qu'a été détecté le premier cas de variant colombien. On l'appelle ainsi car il est prédominant en Colombie, ce variant du Covid-19.

🕐 Mercredi 25 août - Même s'il a fait très peu parler de lui au cours des 9 derniers mois, le variant colombien ne devrait pas tarder à déferler sur la France après le Pas-de-Calais (région montreuilloise) où il avait été détecté en provenance de Belgique. La circulation active du variant b1621 (qui n'est pas le pire parmi les variants préoccupants) montre une présence accrue sur le sol français de variants émergents de SARS-CoV-2. Si pour sa part le variant Delta a une virulence effrayante, cela ne doit pas faire oublier que la souche colombienne est bel et bien présente aussi dans le Nord du pays.

Lors de la contamination du virus colombien en Belgique, la direction de l'établissement de santé avait dit ne pas savoir comment le virus a pu se propager entre ses murs (c'était début août). Depuis d'autres malades ont d'ores et déjà été détectés positifs. N'allons pas pour autant parler d'« effroyable variant colombien » comme on a pu le lire ici ou là, il faut cesser de faire peur aux Français en prenant prétexte de l'épidémie. Le variant lambda arrive lui aussi en France, ce n'est pas la première fois que l'Amérique latine apporte en Europe un virus inconnu: je n'en dirais pas plus.

Comme la notion d'echappement immunitaire est nouvelle pour le grand public et encore très peu présente dans la littérature de vulgarisation scientifique, il est inutile de revenir dessus. Le variant colombien a fait son entrée en Europe, et alors ? serait-on tenté de dire. Quel pays peut se vanter de vivre sans circulation active du virus? Aucun.

Femme colombienne avec le variant

🕐 Mardi 24 août - Une enquête menée en Angleterre ce mois-ci avait montré que le variant colombien n'est pas plus pathogène que ceux que nous connaissons déjà, mais il est encore trop tôt pour faire des déclarations inconsidérées. En Espagne avec le variant Colombien, une 4 ème vague se prépare-t-elle ? Car le pays a des proximités culturelles avec la Colombie, et donc peut-être des personnes infectées qui viennent de Colombie en contaminant potentiellement les Espagnols. Cet été aurons-nous une prochaine annonce en ce sens ? 🤔 En tout cas le vice-ministre de la Santé publique et du Plan Covid-19, Antonio Zapatero, avait mis en garde contre une 4° vague.

Les deux premiers cas du variant colombien de Belgique avaient été repérés en juillet, dans le service destiné aux patients atteints de démence de l'établissement Ter Burg à Zaventem. Malgré leur placement en quarantaine, 21 résidents et sept membres du personnel avaient été contaminés. On ne pouvait pas pour autant parler d'augmentation des infections liées au coronavirus comme variant colombien. Il faudrait pour cela que le continent européen fasse face à une hausse significative des cas de Covid-19 liés au b.1.621 principalement dans les capitales. Or pour l'instant il n'y a rien dans le rapport hebdomadaire de séquençage des variants du Covid-19 (coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère) y compris le variant Lambda du Pérou qui inquiète l'Amérique latine. 🔥

Faire le point sur les variants et leur progression semble plus compliqué que prévu face à la circulation du variant colombien. L'infection du Covid-19 en provenance de Colombie n'a pas explosé comme certains le craignaient (moins de 0,5 % de tous les cas à travers le monde). Depuis l'apparition du premier cas de Sars-CoV-2 de type colombien en région Hauts-de-France, on ne peut pas dire non plus qu'il s'étend désormais dans le monde entier puisque seuls quelques pays sont infectés. Le fameux variant VUM 21H (B.1.621) a encore du chemin a faire avant de prendre le pas sur le variant Delta (indien). 🔥

🕐 Lundi 23 août - Depuis le début de la pandémie, l'arrivée du coronavirus (variant colombien) a mis en évidence 3 mutations que les autorités de santé scrutent particulièrement : E484K, P681H et N501Y. Il ne suffit pas d'évoquer une possible transmission de la souche colombienne du Covid-19 à toute la France pour prétendre que le b.1.621 sera foudroyant quand il arrivera en France, il est trop tôt pour le dire. On sait surtout qu'il sévit en Belgique depuis le mois d'août, à travers des cas qui restent tout de même extrêmement rares depuis l'épisode de la maison de retraite à Zaventem où on a déploré 7 morts en l’espace de deux semaines malgré la vaccination des personnes décédées d'après l’Agence flamande des soins de santé.

Le variant colombien semble progresser dans notre pays, telle est l’évolution de le situation sanitaire relative au covid-19 en France. La nouvelle souche de coronavirus gagne du terrain dans plusieurs régions françaises. Quelles répercussions cela peut-il avoir sur la pandémie ? Baptisé le variant colombien, le B.1.621 est responsable de nouveaux cas de contaminations makis ne semble pas affoler l'OMS.

Recensé dans une dizaine de départements pour l'instant, le variant VUM 21H (B.1.621) s'est installé en France au cours du mois d'août. Particulièrement en Île-de-france qui est la partie du pays la plus touchée. La nature de ce nouveau variant « colombien » est encore mal cernée par les spécialistes depuis qu'il a commencé à faire son apparition dans notre pays en passant par la Colombie puis Miami. Après avoir répertorié cette souche, les autorités mondiales de santé l'ont déclaré moins préoccupante que le Delta qui reste majoritaire en France.

Variant colombien

🕐 Vendredi 20 août - Faute de suffisamment de données sur le suivi de l’évolution du coronavirus, on ne peut que s'interroger sur l'échappement immunitaire de ce variant qui évolue comme le Lambda. Les mutations du virus venant de Colombie incite à la prudence sur le degré de contagiosité et de dangerosité du variant colombien. L'OMS elle-même reste très prudente et parle de VOC (variant of concern). Ce qu’il faut retenir de bilan du mois d'août, c'est que les dizaines de contaminations nouvelles n'ont pas eu d'impact majeur pour l'instant sur le système de santé. Contrairement à la Belgique et les 7 morts de l'Ehpad Ter Burg, victimes du covid avec variant b1621. 🔥

Cela fait une semaine que le variant VUM 21H autrement appelé « colombien » a fait son apparition dans les Hauts de France avec un risque de transmissibilité accrue. Décidément le coronavirus se cache sous de multiples appelations, on ne parle plus uniquement de B.1.621 mais aussi de VUM 21H dorénavant. Dans le jargon de l'OMS, VUM désigne les « variants en cours d'évaluation » donc porteur de mutations génétiques non stabilisées.

🕐 Mercredi 18 août - Actuellement Santé Publique France parle de circulation sporadique, avec une prévalence de 0,3 % qui est effectivement très faible. L'épisode des 7 morts de l'Epahd belge à Zaventem n'a rien changé à cette réalité même si rien n'est sûr autant qu'on sache. La question de l'évasion immunitaire reste centrale : les anticorps post-infectieux ou post-vaccinaux résistent-ils et sont-ils capables d'attaquer la souche colombienne? A ce jour aucune donnée n'est disponible concernant la sévérité des infections du variant colombien du Covid par rapport à la souche originelle.

Au delà de tout affolement, on reste sur une majorité de contamination au variant Delta qui conserve la tête du classement. Mesurer la gravité des infections au variant colombien demanderait plus d'informations sur ces variantes nouvelles pas forcément disponibles actuellement. La sous-espèce colombienne inquiète malgré tout, même si les écouvillonnages nasopharyngés faits par les laboratoires détectent surtout du Delta. De toute façon seuls les plus vulnérables seront concernés par une troisième dose de vaccin contre le Covid-19. 🔥

Au final le variant colombien est-il plus transmissible que les autres ? Résiste-t-il mieux aux vaccins Pfizer et autres ? À quelle fréquence les personnes qui ont reçu le vaccin propagent-elles le Coronavirus dans sa variante de Colombie ? Il est trop tôt pour le dire.

Le sud de la Floride a été concerné dès le mois de juillet quand le variant B1621 a atteint 10% des patients alors qu'on n'en avait encore jamais entendu parler. C'est logique car Miami a un rôle de « pivot » entre l’Amérique latine et l'hémisphère nord. Après le variant Delta et le variant Gamma, quand on aura finit toutes les lettres grecques on pourra repasser aux pays comme la Colombie et le Pérou 🔥. Les voyages internationaux sont propices aux infections, ceci dit comprendre l’impact des mutations sur le Covid reste l'enjeu n°1 et pas uniquement en Colombie.

Covid 19: 7 personnes vaccinées sont mortes après une infection par un nouveau variant. B.1.621 un variant qui pourrait être plus résistant à l'immunité naturelle ou vaccinale (à comparer au variant bêta Sud-Africain) mais probablement moins transmissible que le delta, ce qui signifierait qu'il aurait peu de chance de le supplanter. Espérons-le! A suivre de près.

Que sait-on du variant colombien qui a sévi en Belgique dans une maison de repos ? Pas grand-chose à part que cela avait commencé de la même manière avec le variant Delta. Trafic de faux passes sanitaires : un marché illégal en plein boom ! La loi instaurant l'élargissement du passe sanitaire et la vaccination obligatoire pour les soignants a été validée, jeudi 5 août.

Depuis le début de la pandémie l'apparition de nouveaux variants est constante. La dernière mutation du Covid19 en date qui défrait la chronique est le variant colombien, et on sait la préoccupation de l'Organisation mondiale de la santé à son sujet. Même si plusieurs nouveaux coronavirus font leur apparition, le principal reste celui-ci. 🔥 Quant au variant Lambda qui nous vient du Pérou, il semble résister au vaccin et se propage au Royaume-Uni ainsi que dans une trentaine de pays.

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Aix en Provence, le dimanche 22 mai 2022

Michel Campillo

Michel Campillo Michel Campillo, consultant d'entreprise
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